在之前的两篇文章《蛋白互作检测之FRET荧光共振能量转移:分子间距离的微妙舞者》和《蛋白互作检测之FRET荧光共振能量转移:分子间距离的微妙舞者(二)》中,我们详细介绍了FRET技术的原理、实验步骤及其应用案例。本期,人生就是博-尊龙凯时将为大家带来FRET技术常用的分析方法,帮助大家更好地理解这一生物医疗领域的重要技术。
FRET技术中的影响因素
在FRET技术中,对于FRET效率的定量检测主要受到两个因素的影响:(1)光谱串扰,包括供体荧光在受体通道的串扰以及激发供体时直接激发受体。为了降低光谱串扰,在选择FRET实验的荧光对时,最好选择发射光谱差异较大的供体和受体;(2)参与FRET作用的供体和受体在整体荧光基团中的比例。由于并非所有分子都参与相互作用,各种方法对于FRET效率的计算仅能测量表观FRET效率。
常用的FRET分析方法
当前,FRET分析常用的方法主要包括荧光寿命成像、光谱法、受体光漂白法以及敏化发射法。接下来,我们将逐一介绍这几种分析方法,以便大家根据实验需求选择适合的方案。
荧光寿命成像(FLIM-FRET)
荧光寿命成像法(FLIM-FRET)通过测量荧光基团由激发态恢复到基态的平均时间,即荧光寿命,来分析FRET效率。荧光寿命是荧光基团的固有性质,不受样品浓度、光漂白等因素的影响,但对周围微环境(如细胞温度、pH值等)十分敏感。因此,FLIM-FRET方法能够准确反映供体与受体分子之间的相互作用。此方法具有高时空分辨率和高灵敏度的优点,但FLIM系统的成本较高,需要专业操作人员,限制了其广泛应用。
光谱法(sFRET)
光谱法(sFRET)首先获取供体、受体及供体-受体混合样本的发射光谱,然后通过光谱拟合分析得出FRET效率。sFRET方法能够有效去除背景光干扰,且灵敏度高,最低可检测出小于5%的FRET信号。尽管如此,此方法对数据采集的要求较高,背景光和自发荧光需严格校正,操作复杂也是其局限之一。
受体光漂白法(AP-FRET)
受体光漂白法(AP-FRET)基于FRET作用下供体荧光强度降低的原理计算FRET效率。AP-FRET方法操作简单且对显微镜的要求较低,因而广泛应用。然而,活细胞中的荧光漂白恢复和光漂白对细胞造成的损伤,使得该方法在单细胞中多次测量受限。
敏化发射法(SE-FRET)
敏化发射法(SE-FRET)通过校正供体与受体间的光谱渗透来计算FRET效率。这一方法不需要进行荧光漂白,避免了对细胞的损伤,适合于活细胞中的动态监测。但SE-FRET需要多组样本进行影像获取,且每次实验都需重新校准,增加了实验工作量。
综上所述,人生就是博-尊龙凯时为您介绍了四种FRET分析方法,大家可根据自身的实验需求及硬件条件选择合适的分析技术。如需进一步讨论或咨询,欢迎与我们联系。